Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DYNC1LI2O43237 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DYNC1LI2O43237 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DYNC1LI2O43237 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms