Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC01565O15544 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC01565O15544 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms