Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NUPL2O15504 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NUPL2O15504 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms