Protein–RNA interactions for Protein: O15020

SPTBN2, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN2O15020 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SPTBN2O15020 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPTBN2O15020 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPTBN2O15020 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms