Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRPO00591 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRPO00591 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRPO00591 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRPO00591 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRPO00591 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRPO00591 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRPO00591 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRPO00591 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRPO00591 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRPO00591 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABRPO00591 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRPO00591 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRPO00591 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRPO00591 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRPO00591 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRPO00591 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRPO00591 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRPO00591 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRPO00591 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRPO00591 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRPO00591 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRPO00591 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRPO00591 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRPO00591 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRPO00591 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRPO00591 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRPO00591 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRPO00591 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRPO00591 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRPO00591 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRPO00591 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRPO00591 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRPO00591 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRPO00591 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRPO00591 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRPO00591 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRPO00591 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRPO00591 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRPO00591 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRPO00591 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRPO00591 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRPO00591 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRPO00591 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRPO00591 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRPO00591 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRPO00591 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRPO00591 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GABRPO00591 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GABRPO00591 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRPO00591 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRPO00591 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRPO00591 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRPO00591 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRPO00591 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRPO00591 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABRPO00591 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRPO00591 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRPO00591 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRPO00591 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRPO00591 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRPO00591 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRPO00591 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRPO00591 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRPO00591 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GABRPO00591 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRPO00591 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRPO00591 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRPO00591 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRPO00591 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRPO00591 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRPO00591 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRPO00591 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRPO00591 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRPO00591 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GABRPO00591 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms