Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APOC4-APOC2K7ER74 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOC4-APOC2K7ER74 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APOC4-APOC2K7ER74 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms