Protein–RNA interactions for Protein: F8VP50

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VP50 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
F8VP50 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
F8VP50 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
F8VP50 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
F8VP50 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
F8VP50 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
F8VP50 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
F8VP50 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F8VP50 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
F8VP50 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F8VP50 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
F8VP50 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F8VP50 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F8VP50 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
F8VP50 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F8VP50 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F8VP50 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F8VP50 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
F8VP50 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
F8VP50 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F8VP50 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
F8VP50 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
F8VP50 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
F8VP50 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8VP50 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
F8VP50 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8VP50 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8VP50 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8VP50 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8VP50 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8VP50 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8VP50 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8VP50 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8VP50 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8VP50 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8VP50 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8VP50 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8VP50 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8VP50 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
F8VP50 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8VP50 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8VP50 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
F8VP50 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
F8VP50 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
F8VP50 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8VP50 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8VP50 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8VP50 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8VP50 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8VP50 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8VP50 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8VP50 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8VP50 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8VP50 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8VP50 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8VP50 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8VP50 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8VP50 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8VP50 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8VP50 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8VP50 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8VP50 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8VP50 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8VP50 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8VP50 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8VP50 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
F8VP50 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
F8VP50 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
F8VP50 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
F8VP50 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
F8VP50 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
F8VP50 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8VP50 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
F8VP50 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8VP50 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8VP50 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8VP50 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8VP50 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8VP50 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8VP50 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
F8VP50 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F8VP50 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F8VP50 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F8VP50 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
F8VP50 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
F8VP50 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
F8VP50 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F8VP50 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms