Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USP17L12C9JPN9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP17L12C9JPN9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP17L12C9JPN9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms