Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VGLL3A8MV65 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VGLL3A8MV65 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VGLL3A8MV65 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms