Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZK1P1A8MUH7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZK1P1A8MUH7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms