Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP27XA6NNY8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP27XA6NNY8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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