Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCNX2A6NKB5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCNX2A6NKB5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCNX2A6NKB5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms