Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PSDA5PKW4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.41
PSDA5PKW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PSDA5PKW4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PSDA5PKW4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms