Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
FRMD3A2A2Y4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FRMD3A2A2Y4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FRMD3A2A2Y4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FRMD3A2A2Y4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms