Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
A0A0U1RQJ8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0U1RQJ8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0U1RQJ8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms