Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms