Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP3K4Q9Y6R4 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms