Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms