Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD54L2Q9Y4B4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD54L2Q9Y4B4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms