Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms