Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SETD1BQ9UPS6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms