Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VPS4AQ9UN37 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VPS4AQ9UN37 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms