Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DUSP13Q9UII6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms