Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MLH3Q9UHC1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MLH3Q9UHC1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms