Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSFQ9UBX1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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