Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRPC4Q9UBN4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms