Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC17A7Q9P2U7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms