Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGSF9Q9P2J2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms