Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
USP36Q9P275 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP36Q9P275 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms