Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYP4F12Q9HCS2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms