Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NLRP1Q9C000 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NLRP1Q9C000 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms