Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PACSIN1Q9BY11 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms