Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF17Q9BXT8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms