Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SALL3Q9BXA9 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SALL3Q9BXA9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms