Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BRIP1Q9BX63 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms