Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EFHD1Q9BUP0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms