Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SEMA3CQ99985 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SEMA3CQ99985 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms