Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSPG4P5Q96PW8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms