Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGAP1Q96PV0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGAP1Q96PV0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms