Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRIQ1Q96JM4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms