Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ECHDC3Q96DC8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ECHDC3Q96DC8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHDC3Q96DC8 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHDC3Q96DC8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ECHDC3Q96DC8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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