Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPTSSAQ969W0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms