Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
USP9XQ93008 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms