Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HERVK_113Q902F9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERVK_113Q902F9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms