Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD1Q8NHV4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms