Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CLIP4Q8N3C7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CLIP4Q8N3C7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CLIP4Q8N3C7 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CLIP4Q8N3C7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CLIP4Q8N3C7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CLIP4Q8N3C7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CLIP4Q8N3C7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CLIP4Q8N3C7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLIP4Q8N3C7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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