Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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RAB11FIP4Q86YS3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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RAB11FIP4Q86YS3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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RAB11FIP4Q86YS3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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RAB11FIP4Q86YS3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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RAB11FIP4Q86YS3 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAB11FIP4Q86YS3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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