Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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