Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
USP34Q70CQ2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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USP34Q70CQ2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP34Q70CQ2 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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