Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
BEND4Q6ZU67 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms